2020年2月。世界情勢の悪化により第三次世界大戦の勃発が叫ばれる頃。
突如として現れた反国際連合過激派組織、通称『OUNEO（オウネオ）』は中東一体を武力制圧し、急速にその勢力を強めていた。
主戦場となったイラク西部では国際連合との激しい戦闘が繰り返され、多くの兵士がその命を落としていた。

2021年5月。この状況に危機感を覚えた国際連合は、ハワイ諸島全体を軍の施設として改修する計画を公式に発表。
各国の兵士育成を一律化し、効率良く前線に送ることができるシステムを考案した。

ハワイ諸島は軍施設として改修後、名を『セブンスクルセイド諸島』通称『S.C.A.I（スカイ）』に改め、一年以内に改修を終えた後、 陸海軍幹部候補生、並びに下士官候補生を募り、兵士不足、また、各国による兵士育成システムによる指揮系統混乱解消のための大きな舵取りを担うことなった。

そうして作られた学校が『S.C.A』、セブンス・クルセイド・アカデミーである。

この物語の主人公、朝比奈＝祇音（シオン）・フォン・レーゼンミューラーと杜若神威も、S.C.Aの新入生として入学することになる。

二人を中心とした、軍人を目指す少年少女たちの、愛と友情、裏切りの物語。

全10 章+番外編1本。